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串联亲和纯化(tap)-质谱鉴定 【技术简介】 (1)技术原理 串联亲和纯化(tandem affinity purification, tap)技术基本原理包括:重组构建带有两种亲和纯化标签的融合靶蛋白,然后转染到宿主细胞或组织,带标签的靶蛋白表达并结合上相关蛋白质后,利用标签与相应磁珠作用,两步纯化得到相关蛋白质。tap技术联合质谱对纯化后的蛋白质进行分析,通过生物信息学获得的蛋白相关性可信度高,为后续的验证工作节省大量时间。 (2)技术应用 tap与质谱技术联用已成为一种高效且实用的方法,在生物大分子相互作用领域中被广泛应用。近些年,随着tap标签的全面改进和质谱技术的不断发展,tap-ms的灵敏度与专一性得到很大提高,使得该技术得以在更多领域发挥重要作用,也使得我们对蛋白质复合体进行系统性研究成为可能。 【服务内容】 构建融合flag-ha的诱饵蛋白真核表达载体或者慢病毒载体;载体瞬时转染靶细胞或包装慢病毒感染靶细胞;tap纯化互作蛋白;质谱鉴定互作蛋白。 【客户须知及标本要求】 (1)客户须明确检测目的和具体要求,最好能提供1~2篇文献或资料。 (2)sds-page条带:考染,条带清晰可见;蛋白质溶液:蛋白质总量>5μg/μl。 (3)蛋白洗脱液:定量并计算总蛋白量,真空干燥后,密封好管口,冰袋包装寄送。 (4)蛋白质条带(考染):从凝胶上割取条带时,避免污染,将条带放入ep管内,密封好管口,冰袋包装寄送。
目前,华银中心拥有illumina nextseq 500、hiseq 3000、miseq和ion torrent等高通量测序仪组成的大规模高通量测序服务平台,可以提供涵盖基因组学、转录组学、表观遗传学、免疫组学、蛋白质组学等各种测序服务和高级生物信息分析服务。 nextseq 500和miseq是illumina公司医学领域主流的测序平台组合。nextseq 500能够在高产量运行模式和快速周转运行模式下灵活转换,两者的数据产量分别为30g、120g。miseq系统能够在8小时内从起始样本得到分析数据,是唯一一台集扩增、测序和数据分析于一身的新一代测序仪,每次运行能产生7g数据。ion torrent平台是基于半导体技术的台式高通量测序仪,能根据反应池中的ph的变化快速“读”出dna序列,具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势。
目前,华银高通量检测平台拥有illumina nextseq 500、hiseq 3000、miseq和ion torrent等高通量测序仪组成的大规模高通量测序服务平台,可提供涵盖exosome mirna、exosome lncrna、exosome circrna在内的外泌体组学服务以及基因组学、转录组学、微生物组学、表观组学、免疫组学、核酸与蛋白互作组学、蛋白质组学等各种测序服务和高级生物信息分析服务。
目前,华银中心拥有illumina nextseq 500、hiseq 2500、miseq和ion torrent等高通量测序仪组成的大规模高通量测序服务平台,可以提供涵盖基因组学、转录组学、表观遗传学等各种测序服务和高级生物信息分析服务。 nextseq 500和hiseq 2500平台是illumina公司2014年最新推出的强大而高效的测序系统。它们能够在高产量运行模式和快速周转运行模式下灵活转换,两者的数据最大产量分别为120g、600g。miseq系统能够在8小时内从起始样本得到分析数据,是唯一一台集扩增、测序和数据分析于一身的新一代测序仪,每次运行能产生7g数据。ion torrent平台是基于半导体技术的台式高通量测序仪,能根据反应池中的ph的变化快速“读”出dna序列,具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势。