遗传性耳聋基因检测(100位点)项目升级通知
2024-07-08 阅读数:132
尊敬的客户:
首先感谢您一直以来对广州华银医学检验中心的支持和信赖!
参考升级后的acmg变异评级指南和更新后的耳聋相关研究文献/数据库,我中心于2024年7月15日起对“遗传性耳聋基因检测(100位点)”项目进行升级,详情如下:
1. 检测位点升级(删除4个非致病性变异,新增4个致病性/用药相关变异):
(1)随着变异评级规则的升级和文献/数据库的更新,删除4个非致病性变异,其中1个位于mt-co1 基因(m.7444g>a),2个位于slc26a4 基因(ivs16-6g>a和ivs13 9c>g),1个位于gjb3 基因(c.421_423delatt),以减少临床解读的困扰;
(2)新增4个致病性/用药相关变异(详见表1);
(3)检测基因数和位点数保持不变。
表1 新增变异信息
原耳聋100位点检测项目-删除位点 |
升级后耳聋100位点检测项目-新增位点 |
|||||
基因 |
位点 |
acmg评级 |
acmg评级证据详细描述 |
基因 |
位点 |
acmg评级 |
mt-co1 |
m.7444g>a |
可能良性 |
bs1 bp2(fda)。bs1:mitomap genbank数据库中的频率为206/59389 (0.347%);gnomad数据库中频率为302/56,419 (0.535%)。bp2:在患者中发现其它已知其他线粒体致病突变[m.3460g>a (pmid: 7901141); m.1555a>g (pmid: 16152638)] |
mt-rnr1 |
m.1095t>c |
用药相关 |
slc26a4 |
ivs16-6g>a |
临床意义未明 |
pm3 bs1。pm3:已在1名患者中观察到该位点与其他致病位点组成复合杂合模式[pmid:30703224];bs1:在千人数据库东亚人群频率为0.03% |
gjb2 |
c.109g>a |
致病 |
slc26a4 |
ivs13 9c>g |
临床意义未明 |
pm2_supporting。pm2_supporting:人群数据库中未收录;bp2:隐性遗传模式,存在另一个顺式的致病变异(pmid:11502831) |
slc26a4 |
c.916dupg |
致病 |
gjb3 |
c.421_423delatt |
临床意义未明 |
暂未有合适证据,频率处于pm2_supporting与bs1_p之间,不适用。 |
mt-co1 |
m.7443a>g |
临床意义未明 |
2. 线粒体相关基因位点结果描述:
由原来的“野生型/异质突变/均质突变”改为“野生型/突变型(突变比例)”。本检测报告中线粒体基因相关位点结果仅提示野生型和突变型,并根据该检测方法提示突变比例, 但由于该检测技术局限性或其他无法预知的原因,不能排除与其他方法学突变比例不一致的情况。
3. 报告模板更新:位点信息列表更新、线粒体检测结果描述变更、参考文献库更新(部分位点更新至近三年的文献)。
如有疑问或其它要求请拨打客服免费咨询电话:400-888-1223,我们将竭诚为您服务!
再次感谢您对广州华银医学检验中心的支持!
广州华银医学检验中心
二〇二四年七月八日