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遗传性耳聋基因检测(100位点)项目升级通知

2024-07-08 阅读数:132

尊敬的客户:

首先感谢您一直以来对广州华银医学检验中心的支持和信赖!

参考升级后的acmg变异评级指南和更新后的耳聋相关研究文献/数据库,我中心于2024715日起遗传性耳聋基因检测(100位点)项目进行升级,详情如下:

1. 检测位点升级(删除4个非致病性变异,新增4个致病性/用药相关变异):

1)随着变异评级规则的升级和文献/数据库的更新,删除4个非致病性变异,其中1个位于mt-co1 基因(m.7444g>a),2个位于slc26a4 基因(ivs16-6g>aivs13 9c>g),1个位于gjb3 基因(c.421_423delatt),以减少临床解读的困扰;

2)新增4个致病性/用药相关变异(详见表1);

3)检测基因数和位点数保持不变。

1 新增变异信息

原耳聋100位点检测项目-删除位点

升级后耳聋100位点检测项目-新增位点

基因

位点

acmg评级

acmg评级证据详细描述

基因

位点

acmg评级

mt-co1

m.7444g>a

可能良性

bs1 bp2fda)。bs1mitomap genbank数据库中的频率为206/59389 (0.347%);gnomad数据库中频率为302/56,419 (0.535%)bp2:在患者中发现其它已知其他线粒体致病突变[m.3460g>a (pmid: 7901141); m.1555a>g (pmid: 16152638)]

mt-rnr1

m.1095t>c

用药相关

slc26a4

ivs16-6g>a

临床意义未明

pm3 bs1pm3:已在1名患者中观察到该位点与其他致病位点组成复合杂合模式[pmid:30703224]bs1:在千人数据库东亚人群频率为0.03%

gjb2

c.109g>a

致病

slc26a4

ivs13 9c>g

临床意义未明

pm2_supportingpm2_supporting:人群数据库中未收录;bp2:隐性遗传模式,存在另一个顺式的致病变异(pmid11502831

slc26a4

c.916dupg

致病

gjb3

c.421_423delatt

临床意义未明

暂未有合适证据,频率处于pm2_supportingbs1_p之间,不适用。

mt-co1

m.7443a>g

临床意义未明

2. 线粒体相关基因位点结果描述:

由原来的野生型/异质突变/均质突变改为野生型/突变型(突变比例)。本检测报告中线粒体基因相关位点结果仅提示野生型和突变型,并根据该检测方法提示突变比例, 但由于该检测技术局限性或其他无法预知的原因,不能排除与其他方法学突变比例不一致的情况。

 

 

3. 报告模板更新:位点信息列表更新、线粒体检测结果描述变更、参考文献库更新(部分位点更新至近三年的文献)。

如有疑问或其它要求请拨打客服免费咨询电话:400-888-1223,我们将竭诚为您服务!

再次感谢您对广州华银医学检验中心的支持!

广州华银医学检验中心

                                       二〇二四年七月八日

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